Различные способы записи Митохондриального кода

Из соображений удобства или по другим соображениям многие исследователи изображают или записывают генетические коды по разному. Один из способов, Табличный, мы можем видеть наверху. Другой из способов Секторный, в котором мононуклеотиды и аминокислоты расположены в секторах радиальных кругов. Количество секторов легко считается и в определенном смысле эта запись более симметрична.

Еще один способ Диагонально-матричный, в котором ДНК(64)-мРНК(64)-тРНК(22)-АК(20) матрица приведена к диагональному виду, чтобы лучше увидеть симметрию и малость вероятностей неправильных узнаваний кодонов-антикодонов и аминокислот.

Также существует запись в виде объединенных групп кодоны-аминокислоты по степени(классам вырождения аминокислот):

1. Из таблицы 1 следует, что Митохондриальный код весьма симметричен. Аминокислоты сгруппированы по 2 или 4 кодонам, как уже упоминалось выше при узнавании тРНК кодонов мРНК. 64 кодона разбиты на 16 пар кодонов и на 8 четверок (если считать СТОП кодоны тоже). 2. Кроме того, он содержит 2 класса вырождения {6} по аминокислотам, 6 классов вырождения {4}, 12 классов классов вырождения {2}и СТОП кодоны, которых почти нет в геноме и они не соответствуют никаким классам вырожения аминокислот, либо пустому множеству. 3. Уравнения(Диофантова система), которыми описывается такое разбиение содержит сравнение по (mod 12), а именно:

2X + 4Y + 6Z = 60, исключены СТОП кодоны
X + Y + Z = 20, приведение по модулю 3
2X = 4Y = 6Z = 0 (mod 12), приведение по модулю 5

Откуда следует вышенаписанное разбиение, симметрия 5 порядка и по всей видимости связь с Кодом Ферма-Эйлера (4,3,20)



Рекомендуем посетить:


©2008 - Мир генетики и генеалогии
Главная Наверх Карта сайта