После проверки и объединения результатов нескольких STR из одного генома определяется гаплотип, который может быть представлен в виде последовательности числа каждого маркера. Тест из 12 маркеров может быть похож на данную таблицу:
| STR Маркеры Y-ДНК | ||||||||||||
| 19 | 385a | 385b | 388 | 389i | 389ii | 390 | 391 | 392 | 393 | 425 | 426 | |
| Your Haplotype | 14 | 12 | 17 | 12 | 13 | 29 | 24 | 11 | 13 | 13 | 12 | 10 |
Маркеры STR записаны в заголовке, а сам гаплотип в ячейках таблицы.
Так, например, для DYS19 написано 14 повторов. Гаплотип может дать
информацию о том, откуда произошла ваша Y-хромосома, то есть проследить
весь путь предков данного человека в течение 100 тысяч лет. Например,
Атлантический Модальный Гаплотип (AMH) определен только шестью
маркерами, и это самый общий гаплотип в Западной Европе.
| 19 | 388 | 390 | 391 | 392 | 393 |
| 14 | 12 | 24 | 11 | 13 | 13 |
В базе данных YHRD
каждый может сравнить его гаплотип с другими занесенными в неё
образцами. Эта база данных содержит большое количество евразийских
образцов, а теперь содержит еще и образцы американцев и жителей
восточной Азии, а также эскимосов. База данных YHDR использует до одинадцати маркеров.
Кроме этого, Ybase — полезный инструмен исследователя и позволяет добавить результаты своих тестов Y-хромосомы в базу данных.
Интереснейший проект-база данных гаплотипов и генеалогических данных — Sorenson Molecular Genealogy Foundation. После заполнения в критериях поиска гаплотип, программа покажет в результатах самые близкие по совпадениям гаплотипы с фамилиями людей и покажет генеалогическое древо, где будет показан предполагаемый общий предок и все другие образцы, с которыми совпали результаты маркеров. В этой базе данных зарегестрировано более 50000 гаплотипов.
Тестирование Y-хромосомы наиболее интересно, если сравнивать результаты двух и более человек совместно с результатами традиционных генеалогических поисков. Ниже описан гипотетический случай, где три генетических кузена с одной одной фамилией прошли тест.
В какой-то момент в прошлом этой семьи произошла единственная мутация в Y-хромосоме. Эта мутация оставила след в ДНК всех мужчин этой семьи . При сравнении их гаплотипов наблюдается следующее:
| Y-DNA STR Markers | ||||||||||||
| 19 | 385a | 385b | 388 | 389i | 389ii | 390 | 391 | 392 | 393 | 425 | 426 | |
| Кузен 1 | 14 | 12 | 17 | 12 | 13 | 29 | 24 | 11 | 13 | 13 | 12 | 10 |
| Кузен 2 | 14 | 12 | 17 | 12 | 13 | 29 | 24 | 11 | 13 | 13 | 12 | 10 |
| Кузен 3 | 14 | 12 | 17 | 12 | 13 | 29 | 24 | 11 | 14 | 13 | 12 | 10 |
В этой таблице большинство чисел совпадают, за исключением маркера
помеченного серым цветом. У участника № 3 показана мутация в DYS392.
Участники № 1 и № 2, цифры которых полностью совпадают, очень близкие
родственники. Участник № 3 тоже является их родственником, но более
далеким.